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突變“熱點(diǎn)”揭示癌癥誘發(fā)新因素

2022年02月10日 12:18:57 來(lái)源:科技日?qǐng)?bào) 作者:張佳欣

  美國(guó)加州大學(xué)圣地亞哥分校的生物工程師們?cè)谧钚卵芯恐邪l(fā)現(xiàn)了癌癥進(jìn)化中一個(gè)此前未被認(rèn)識(shí)到的關(guān)鍵角色:基因組某些區(qū)域發(fā)生的簇狀突變。研究人員發(fā)現(xiàn),“簇狀體細(xì)胞突變”在大約10%的人身上誘發(fā)了癌癥進(jìn)展,了解它們可以預(yù)測(cè)患者的存活率。相關(guān)論文9日發(fā)表在《自然》網(wǎng)站上。

  簇狀意味著它們?cè)诩?xì)胞基因組的特定區(qū)域聚集在一起,而體細(xì)胞意味著它們的遺傳信息不會(huì)傳遞給下一代。

  該團(tuán)隊(duì)在創(chuàng)建迄今最全面、最詳細(xì)的已知簇狀體細(xì)胞突變圖時(shí)做出了這一發(fā)現(xiàn)。他們首先繪制了2500多名癌癥患者的基因組中的所有突變(簇狀和非簇狀),這項(xiàng)工作總共涵蓋了30種不同的癌癥類(lèi)型。研究人員使用了人工智能,通過(guò)算法來(lái)檢測(cè)每個(gè)患者體內(nèi)的簇狀突變,并闡明導(dǎo)致此類(lèi)事件的潛在突變過(guò)程。他們發(fā)現(xiàn),在大約10%的人類(lèi)癌癥中,簇狀體細(xì)胞突變有助于癌癥的進(jìn)化。

  研究人員進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),一些癌癥誘發(fā)簇,特別是在已知癌癥誘發(fā)基因中發(fā)現(xiàn)的那些簇,可以用來(lái)預(yù)測(cè)患者的總體存活率。例如,BRAF基因(黑色素瘤中最廣泛觀(guān)察到的驅(qū)動(dòng)基因)中簇狀突變的存在可提高患者的總體存活率。然而,EGFR基因(肺癌中最廣泛觀(guān)察到的驅(qū)動(dòng)基因)中簇狀突變的存在導(dǎo)致患者存活率下降。

  研究人員表示,他們發(fā)現(xiàn)不同的存活率僅僅是在這些基因中檢測(cè)到簇狀突變,這在臨床上常用的現(xiàn)有平臺(tái)上是可以實(shí)現(xiàn)的。因此,這是一個(gè)簡(jiǎn)單而精確的判斷患者存活率的生物標(biāo)記物。

  研究人員還確定了導(dǎo)致簇狀體細(xì)胞突變的各種因素。這些因素包括紫外線(xiàn)輻射、飲酒、吸煙等。

  此外,一組名為APOBEC3的抗病毒酶的活性可能會(huì)導(dǎo)致這種突變,加速癌癥發(fā)展。研究人員表示,這是一種全新的致癌模式。這為新的治療方法奠定了基礎(chǔ),臨床醫(yī)生可以考慮限制APOBEC3酶的活性和/或針對(duì)染色體外環(huán)狀DNA(ecDNA)來(lái)治療癌癥。

[編輯: 陳路漫]
(本文來(lái)源:科技日?qǐng)?bào))
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