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細胞有絲分裂期轉(zhuǎn)錄調(diào)控動態(tài)機制揭示

2023年02月14日 10:29:46 來源:科技日報 作者:吳長鋒

  記者13日從中國科學技術(shù)大學了解到,該校生命科學與醫(yī)學部瞿昆教授課題組和合肥微尺度物質(zhì)科學國家研究中心王志凱特任研究員團隊合作,揭示了細胞有絲分裂期轉(zhuǎn)錄調(diào)控動態(tài)機制。相關(guān)研究成果日前發(fā)表于《科學進展》。

  細胞在進入有絲分裂時,通常伴隨著染色質(zhì)的逐漸固縮和基因轉(zhuǎn)錄的顯著減少,而當細胞退出有絲分裂時,子細胞的染色質(zhì)狀態(tài)和基因轉(zhuǎn)錄又逐漸被重新激活。在整個過程中,細胞的染色質(zhì)狀態(tài)是如何動態(tài)變化的,又存在什么樣的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄調(diào)控,探究這些問題對于理解有絲分裂期“轉(zhuǎn)錄記憶”的傳遞具有重要意義。

  研究團隊繪制了來自有絲分裂不同時期的6538個L02胎肝細胞的高質(zhì)量染色質(zhì)可及性圖譜,并通過假時間軌跡、多組學整合、原位成像、轉(zhuǎn)錄因子擾動等干濕結(jié)合的分析策略系統(tǒng)性探究了有絲分裂期染色質(zhì)狀態(tài)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控的動態(tài)變化。

  研究人員首先通過假時間軌跡分析構(gòu)建了有絲分裂時間軸,發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)可及性在細胞進入有絲分裂期后持續(xù)降低并在中期之后開始增加;谠撌状蚊枥L的有絲分裂期染色質(zhì)狀態(tài)動態(tài)變化圖譜,研究人員發(fā)現(xiàn)7%的染色質(zhì)區(qū)域在該過程中始終保持活躍狀態(tài),并將其定義為書簽區(qū)域。進一步分析發(fā)現(xiàn),書簽區(qū)域是多種細胞類型共有的表觀遺傳特征,其主要位于基因啟動子區(qū)域,并且染色質(zhì)狀態(tài)的活躍程度與基因激活速率顯著正相關(guān),這些結(jié)果決定了管家基因在有絲分裂后的首先被激活。

  接下來,研究人員發(fā)現(xiàn)靶向書簽區(qū)域的轉(zhuǎn)錄因子比細胞類型特異性轉(zhuǎn)錄因子更早地結(jié)合染色質(zhì),這種轉(zhuǎn)錄因子與染色質(zhì)的動態(tài)相互作用決定了基因重激活的動態(tài)過程。

  該研究揭示了有絲分裂期細胞染色質(zhì)可及性先減少后增加的動態(tài)變化和作為“轉(zhuǎn)錄記憶”載體始終活躍的染色質(zhì)可及區(qū)域,發(fā)現(xiàn)了大規(guī)模轉(zhuǎn)錄因子與染色質(zhì)的動態(tài)相互作用過程,從中鑒定了新的調(diào)控基因重激活的轉(zhuǎn)錄因子NF-YA,從而構(gòu)建整個有絲分裂期轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)演變過程。

[編輯: 王航飛]
(本文來源:科技日報)
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