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基因組分析顯示:新冠病毒難長存

2020年03月10日 17:03:01 來源:科技日報(bào) 作者:胡定坤

  本報(bào)記者 胡定坤

  新冠病毒是否將徹底滅絕?不少專家認(rèn)為,新冠肺炎可能轉(zhuǎn)化為一種慢性疾病,新冠病毒有可能在人體內(nèi)長期潛伏,和人類長期共存。難道說我們真的要長期生活在新冠疫情的陰影之下?

  對此,南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院副教授高山在接受科技日報(bào)記者采訪時表達(dá)了不同看法。日前,高山等在ResearchGate網(wǎng)站發(fā)表預(yù)印本文章《5’非翻譯區(qū)條形碼揭示2019新型冠狀病毒毒力》,提出新冠病毒毒力與SARS接近,很難與人類長期共存,但我們要高度警惕潛伏在野生動物身上的“新對手”。

  新冠病毒毒力強(qiáng)很難與宿主長期共存

  高山介紹,冠狀病毒RNA編碼區(qū)上游的“5’非翻譯區(qū)”雖然并不表達(dá),但其內(nèi)部的“核糖體進(jìn)入位點(diǎn)”(簡稱第一位點(diǎn))卻可以調(diào)控冠狀病毒大部分蛋白質(zhì)的翻譯,其功能至關(guān)重要,是影響病毒毒力的關(guān)鍵因素。

  于是,高山等研究了1200多條Beta冠狀病毒的基因組,發(fā)現(xiàn)可根據(jù)第一位點(diǎn)內(nèi)的一段特殊序列將上述所有病毒分為四類,每一類病毒的毒力接近,特殊序列幾乎完全相同。其中第一類包括中東呼吸綜合征(MERS)病毒及蝙蝠體內(nèi)的HKU4病毒等,毒力最強(qiáng);SARS病毒、新冠病毒同屬第二類,毒力僅次于前者;第三類則包括毒力更弱的OC43、HKU1等人類冠狀病毒;前三類之外的冠狀病毒全部歸為第四類。

  “這一特殊序列就像是給病毒打上的條形碼!备呱秸劦剑@種分類方式非常清楚,不同類之間的冠狀病毒毒力差距顯著。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),這四類Beta冠狀病毒第一個基因的起始密碼子上游臨近的莖環(huán)結(jié)構(gòu)恰好呈現(xiàn)出4種不同的形態(tài)。

  高山認(rèn)為,根據(jù)現(xiàn)有數(shù)據(jù),第一、二類中已發(fā)現(xiàn)病毒的種類和宿主種類都較少,很可能是因?yàn)槎玖μ珡?qiáng),病毒很難與宿主長期共存而逐漸滅絕,而第三類病毒毒力較弱,經(jīng)過長期進(jìn)化有可能獲得宿主適應(yīng)性,實(shí)現(xiàn)在宿主中長期存在!皸l形碼”序列的保守性強(qiáng),不易變異,新冠病毒不太可能進(jìn)化成為第三類病毒。按照其分類和毒力,只要人類采取有力的防控措施,它大概率將走向滅絕。

  病毒可以分類管潛在威脅要警惕

  高山告訴科技日報(bào)記者,根據(jù)“條形碼”對冠狀病毒分類,可以簡單、快速估計(jì)未知病毒毒力,為病毒分級管理奠定基礎(chǔ),使未來防控更有針對性。例如蝙蝠攜帶的HKU4、HKU5和刺猬攜帶的HKU31等多種冠狀病毒屬于第一類,雖然尚未報(bào)道感染人的情況,但仍應(yīng)被列入重點(diǎn)監(jiān)控和研究目標(biāo)。

  “此外,近期報(bào)道在穿山甲體內(nèi)存在與新冠病毒高度類似的冠狀病毒。”高山談道,雖然穿山甲未必是新冠病毒的中間宿主,因?yàn)閮煞N病毒在可變翻譯分型上并不相同,而且穿山甲冠狀病毒基因組沒有新冠病毒特有的Furin酶切位點(diǎn)。但是,人類仍需重視該病毒的潛在威脅,研究發(fā)現(xiàn)它屬于第二類病毒,估計(jì)其毒力與SARS病毒和新冠病毒在同一水平。因此,加強(qiáng)對攜帶危險(xiǎn)病毒的穿山甲等野生動物的研究和監(jiān)控很有必要。

  “總之,我們要高度警惕已經(jīng)發(fā)現(xiàn)和未來可能出現(xiàn)的毒力較強(qiáng)的第一、二類病毒。”高山指出,相比之下,第三類病毒種類多、宿主廣泛,有可能出現(xiàn)周期性的小范圍暴發(fā),但毒力較弱、威脅較小。

  “按照‘條形碼’序列對病毒分類并不局限于Beta冠狀病毒!备呱奖硎荆覀儗⑵鋺(yīng)用于甲型流感病毒分析,結(jié)果與常規(guī)采用的血清型分類高度一致,該病毒的12個HA亞型和8個NA亞型各有一張一一對應(yīng)的“條形碼”。

  高山強(qiáng)調(diào),當(dāng)前他們的研究主要基于對病毒基因組的生物信息學(xué)分析,仍需大量的生物學(xué)實(shí)驗(yàn)確認(rèn)。

[編輯: 王姝]
(本文來源:科技日報(bào))
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